본 글에서는 바이오칩 시스템에서 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction, PCR)의 직접적인 정량화를 위한 이미지 분석 애플리케이션을 소개하고자 한다. 설계된 툴을 이용하면 디지털 이미지 프로세싱 알고리즘으로 디지털 입력 이미지에서 의미있는 정보를 추출할 수 있다. 이미지 분석은 마이크로칩 웰 형광(microchip wells fluorescence)을 읽는 것처럼 단순해질 수 있다.
이미지 데이터 추출을 최적화하기 위해 디지털 입력 이미지 로드, 웰 정렬 자동화 및 검출, 데이터 입력 정밀화, 셀의 통계적 평균 이미지 값 계산, 출력으로 적합커브(fitted curve) 작성, 각 웰에 사이클 임계값(Cycle Threshold, CT) 및 슬로프 파라미터 부여가 가능한 소프트웨어가 개발되었다. 실행된 수학적 모델을 통해 평균 형광 증폭 측정 및 PCR 커브 피팅을 쉽게 할 수 있다.
제공: ST마이크로 일렉트로닉스, www.st.com
Keywords: 이미지 분석, PCR, 에지 검출(Edge detection), 허프 변환(Hough transform)
저자 소개.
Massimo Orazio Spata, massimo.spata@st.com (1)
Sabrina Conoci, sabrina.conoci@st.com (2)
Maria Eloisa Castagna, mariaeloisa.castagna@st.com (3)
Salvatore Rinaudo, salvatore.rinaudo@st.com (4)
1,2,3: STMicroelectronics, Department: IMS – Research & Development
4: STMicroelectronics
